四コマ漫画『キルミーベイベー』各巻の簡易目次のようなもの。
※単行本には詳しい目次が設けられていないので、参考までに簡単な概要を記した。
※おまけページのイラストなど、一部は省略している。
※アニメ版の詳細は、別掲記事「
『キルミーベイベー』漫画版とアニメ版の比較」を参照。
| 単行本第1巻（2009年2月11日発行） |
| ページ | エピソード概要 | 備考（アニメ版など） |
| 表紙 | キルミーダンス | アニメ版：エンドロール映像 |
| カラー | トントン相撲（ペーパークラフト） | － |
| カラー | まちがい探し | － |
| カラー | ミニ将棋（ペーパークラフト） | － |
| カラー | 福笑い（ペーパークラフト） | － |
| カラー | たのしいぬりえ | － |
| 9～16 | 殺し屋ソーニャ、ゴキブリ | アニメ第1話 |
| 17～24 | 技を習う、鳥よけ、相撲 | アニメ第1、3話 |
| 25～32 | お化けの出る教室、あぎり登場 | アニメ第1話 |
| 33～38 | 野良犬が教室に | アニメ第1話 |
| 39～46 | 超能力（スプーン曲げなど） | アニメ第3話 |
| 47～54 | さまざまな技を習う | アニメ第2話 |
| 55～62 | 屋上でヌンチャク | アニメ第2話 |
| 63～68 | ジュース開栓 | アニメ第1話 |
| 69～76 | 公園で熊に遭遇 | アニメ第2話 |
| 77～84 | 扇子、浜辺でスイカ割り | アニメ第4話 |
| 85～92 | 迷い猫を追いかける | － |
| 93～100 | スーツ姿の刺客 | アニメ第4話 |
| 101～108 | ハリセン、ワンワン、ギプスのソーニャ、蜂 | アニメ第2話 |
| 109～116 | 台風の日 | アニメ第3、6話 |
| 117 | 内部図解 | － |
| 118 | 没キャラ | － |
| 単行本第2巻（2010年2月11日発行） |
| ページ | エピソード概要 | 備考（アニメ版など） |
| 表紙 | 二人三脚 | － |
| カラー | ペーパークラフト（三人の立体化） | － |
| カラー | ミルキーベイベー（ボクシング） | － |
| カラー | ひみつの衣装部屋（コスチューム） | － |
| 9～16 | 呪いの藁人形 | アニメ第3話 |
| 17～24 | ラジコンと折り紙飛行機 | アニメ第10話 |
| 25～32 | 雪だるま、雪合戦 | アニメ第10話 |
| 33～40 | 仕事に行こうとするソーニャ | アニメ第13話 |
| 41f.、75f. | 動物対決（蛇、虎） | － |
| 43～50 | あぎりの忍術（変わり身、各種巻物） | アニメ第話 |
| 51～58 | 睡眠不足のソーニャ | アニメ第12話 |
| 59～66 | 頭を良くする（知恵の輪、魚弁当、ヨガ） | アニメ第3、4話 |
| 67～74 | オモチャの手錠 | アニメ第13話 |
| 77～84 | アイスを買う | アニメ第4話 |
| 85～92 | 夏祭 | アニメ第5話 |
| 93～100 | 人形劇の練習 | アニメ第5話 |
| 101～108 | かき氷 | アニメ第6話 |
| 109～116 | 絆創膏、湿布、防弾チョッキ | アニメ第12話 |
| 117 | 超ショートスゴロク | － |
| 118 | 竹キル物語 | アニメ第11話 |
| 単行本第3巻（2011年3月13日発行） |
| ページ | エピソード概要 | 備考（アニメ版など） |
| 表紙 | ゾンビーベイベー | アニメ第11話 |
| 裏表紙 | ステレオグラム（立体視） | － |
| カラー | クラフトプレーン | アニメ第10話（アイキャッチ） |
| カラー | キル太郎 | アニメ第11話 |
| カラー | キルミーちゃんストラップ広告 | － |
| 9～16 | 蚊 | アニメ第7話 |
| 17～24 | クリスマスのソーニャ、新年会 | アニメ第10話 |
| 25～32 | 凧揚げ | アニメ第11話 |
| 33～40 | 風邪を引いたやすな | アニメ第10話 |
| 41～48 | 楽器演奏（タンバリン、シンバル） | アニメ第8話 |
| 49～56 | あぎりの家を訪れる | アニメ第6話 |
| 57～64 | 公園で子供と遊ぶ | アニメ第2話 |
| 65～72 | ジャグリング、皿回し | アニメ第7話 |
| 73～80 | やすなに変装した刺客たち | アニメ第4話 |
| 81～88 | 校内で虫捕り、あぎりの九官鳥 | アニメ第5話 |
| 89～96 | ダーツで勝負 | アニメ第8話 |
| 97～102 | 一斗缶が頭に嵌まったやすな | アニメ第8話 |
| 103～110 | 防災（消火器、地震） | － |
| 111～118 | ターゲットの写真、ソーニャを優しくさせる | アニメ第12話 |
| 単行本第4巻（2012年2月11日発行） |
| ページ | エピソード概要 | 備考（アニメ版など） |
| 表紙 | キルミアン（エイリアン） | － |
| カラー | だるま落としマスコット（ペーパークラフト） | － |
| カラー | 横長4コマ | － |
| カラー | パラパラマンガ | － |
| カラー | リバーシブルメモ帳 | － |
| 9～16 | 餅つき | アニメ第11話 |
| 17～24 | 瓦割り | OVA |
| 25～32 | 落とし物 | アニメ第9話 |
| 33f.、59f.、93f. | ネジ巻きロボットと呪いの人形 | － |
| 35～42 | トイレの霊 | OVA |
| 43～50 | ソーニャの誕生日パーティー | アニメ第13話 |
| 51～58 | ツチノコと刺客 | アニメ第9話 |
| 61～68 | 池で釣り | アニメ第9話 |
| 69～76 | 強運（あっち向いてホイ、危機一髪） | アニメ第9話 |
| 77～84 | つきまとう呪いの人形 | － |
| 85～92 | 催眠術（アロマ、鏡） | － |
| 95～102 | 犬を散歩させるやすな | － |
| 103～110 | ハロウィーンをなめない方が良い | OVA |
| 111～118 | 節約（貯金箱、やって欲しいこと） | － |
| 単行本第5巻（2013年4月11日発行） |
| ページ | エピソード概要 | 備考（アニメ版など） |
| 表紙 | 合体変形キルバスター | － |
| カラー | ペーパージオラマ（路上） | － |
| カラー | キルキュラ（ドラキュラ） | － |
| カラー | いろいろなやすな&ソーニャ（ハーピー、イカなど） | － |
| 9～16 | 手が冷たい、ギプスのやすな | OVA |
| 17～24 | 壁の穴に嵌まるソーニャ | － |
| 25～32 | スポーツ（サッカー、鉄棒など） | － |
| 33f.、59f.、85f. | 宇宙人に変化、キノコに変化 | － |
| 35～42 | 植物（花束、サボテン、感動的な桜） | － |
| 43～50 | 仏像時計 | OVA |
| 51～58 | 新聞紙の剣、鯉のぼり | － |
| 61～68 | 殺虫レーザーメカ | － |
| 69～76 | 山でキャンプ | － |
| 77～84 | 大人っぽくなりたい（辛味、化粧） | － |
| 87～94 | キノコが生える | － |
| 95～102 | 偽あぎりの刺客 | OVA |
| 103～110 | 凍った池でスケート | － |
| 111～118 | 新年（お年玉要求、折部神社、羽子板勝負） | － |
| 単行本第6巻（2014年4月11日発行） |
| ページ | エピソード概要 | 備考（アニメ版など） |
| 裏表紙 | 殺し屋探偵（漫画） | － |
| カラー | キルミーカー（ペーパークラフト） | － |
| カラー | 荒野のキルミー | － |
| 9～16 | あぎりの蔵掃除（からくり人形、巻物ヌンチャク、お気に入りの壺） | OVA |
| 17～24 | 爆弾刺客との電話（びっくり箱、クマゴン人形） | － |
| 25～32 | 二人で着ぐるみに入る（のっぽっぽくん） | － |
| 35～42 | コンテスト用の写真撮影（かっこいいポーズ、決定的瞬間、オカルト雑誌） | － |
| 43～50 | 感情のコントロール（泣ける本、不意打ちビンタ、激辛スプレー） | － |
| 51～58 | 階段を上る（ツン胃テールを引っ張る、記憶喪失になったソーニャ） | － |
| 61～68 | あぎりの吹き矢（解毒剤、激辛ソース） | － |
| 69～76 | 喉が嗄れた | － |
| 77～84 | ペット（猛獣、あぎりの忍蛇） | － |
| 87～94 | 落ち葉掃除（エアースラッシュ掃き、マジカルウィッチ掃き、イモムシ） | － |
| 95～102 | 忍者屋敷迷路アトラクション（鍵穴いっぱい、時限爆弾） | － |
| 103～110 | 心眼（アイマスク） | － |
| 111～118 | 刺客デスコタツ | － |
| 単行本第7巻（2015年5月12日発行） |
| ページ | エピソード概要 | 備考 |
| 表紙 | イカとタコの憑依 | － |
| カラー | ペープサート（ペーパークラフト） | － |
| カラー | キルミー合成実験室（ソやーすニなャ） | － |
| カラー | キルの魔法使い | － |
| 9～16 | バランスボール、片足立ち、一輪車 | － |
| 17～24 | ローラースケートで帰宅（ラジコン化、手足で4個装備に） | － |
| 25～32 | 健康（規則正しい生活、寄生虫の鳴き声、ボクシングのエクササイズ） | － |
| 33～40 | 山で捜し物（埋まっていたあぎり、ハニワからムカデ、爆弾型のタイムカプセル） | － |
| 41～48 | 霊憑依（バナナの霊、双子の姉妹ターニャ） | － |
| 51～58 | 池の刺客デビルオクトパス（石投げ、激辛ソース、バナナ） | － |
| 59～66 | 喋るオウム鳥政（メカオウム様） | － |
| 67～74 | 記憶力（命日は覚えておいてやるよ、神経衰弱） | － |
| 77～84 | スルメの加工工場（イカの霊） | － |
| 85～92 | 組み立てロボット（マヨネーズ出し機） | － |
| 95～102 | あぎりの忍者ゴーカート（手裏剣カー、バズーカー、UFOカー、緊急脱出ボタン） | － |
| 103～110 | 忍の里の秘伝のツボ（壺と甕） | － |
| 111～118 | カブラチュパホイホイ | － |
| 単行本第8巻（2016年7月12日発行） |
| ページ | エピソード概要 | 備考 |
| 表紙 | キルゴンファンタジー | － |
| カラー | キルミーモビール（ペーパークラフト） | － |
| カラー | スペースキルミー | － |
| カラー | 色々変化キルミー（モンスター化など） | － |
| 9～16 | 古い玩具箱（けん玉、跳ねるカエル、ヨーヨーなど） | － |
| 17～24 | コンテスト用の映像撮影（「間抜けの生態」） | － |
| 25～32 | 形意拳（貝毒、ショベルカー拳、フジツボ拳） | － |
| 35～42 | あぎりの忍者お化け屋敷（忍者の幽霊、忍者ゾンビ） | － |
| 43～50 | 刺客ファントム・ガス | － |
| 51～58 | サッカー盤ゲーム（選手ミニチュアを怪獣や生首に入れ替え） | － |
| 61～68 | 我慢比べ（苛立ち、ケーキ） | － |
| 69～76 | やすなの全身アーマー（関節技、完全防御形態） | － |
| 77～84 | 不幸の腕輪、あぎりの占い館 | － |
| 85～92 | じゃんけんハンマー勝負（プロルール、武器の種類を増やす） | － |
| 93～100 | エキサイティング折り紙（芸術点勝負） | － |
| 101～108 | ほら穴の調査（忍者グッズショップの倉庫、度遁スコップ、温泉発見） | － |
| 111～118 | 必殺パンチで勝負（騙し打ちナックル、不意打ちブレード） | － |
| 単行本第9巻（2017年11月11日発行） |
| ページ | エピソード概要 | 備考 |
| 表紙 | キルミーボーン | － |
| カラー | キルミーイモムシ（ペーパークラフト） | － |
| カラー | 怪盗キルミー | － |
| 9～16 | 生け花で勝負（あぎりの判定、花人間、剣山） | － |
| 17～24 | 汚染川の巨大トカゲ | － |
| 25～32 | パチンガーY（イモムシのカプセルトイ） | － |
| 33～40 | 呪いのバット | － |
| 41～48 | ラジコン戦車（コントローラーアタック、忍者の対戦型ロボラジコン、分身の術） | － |
| 51～58 | 体育館で（ダンクシュート、バットとバレーボールでバドミントン） | － |
| 59～66 | 指人形と人形遣いの刺客（五体合体、ロング指人形、パペットガン） | － |
| 67～74 | マンドラゴラ栽培 | － |
| 77～84 | 弓矢（リンゴ当て、火矢、弓矢でバトル） | － |
| 85～92 | ウナギ（ウナギ模型、護身剣ウナブレード、卯ナギ） | － |
| 93～100 | バズーカ勝負とあぎりのロデオマシーン | － |
| 103～110 | 幽体離脱薬（寿命と尊厳が減る、鹿の頭の剥製のマネ） | － |
| 111～118 | 粘土（可食粘土、年度でソーニャヘッド、絶対防御粘土スーツ） | － |
| 単行本第10巻（2018年12月12日発行） |
| ページ | エピソード概要 | 備考 |
| 表紙 | ネコ化 | － |
| カラー | ゆびにんぎょう（ペーパークラフト） | － |
| カラー | キル魚姫 | － |
| 9～16 | あぎりのホラーお化け屋敷（クリーチャー多数） | － |
| 19～24 | 掃除時間（ツインブレード箒、ロボット掃除機） | － |
| 25～32 | 芋畑（投石芋、斧芋、ムチイモ、ヨロイモ） | － |
| 35～42 | びっくり箱（プレイヤー入り、罠箱、クリーチャー箱） | － |
| 43～50 | UFOを探しに行く（落雷） | － |
| 51～58 | サバイバルするゲーム（孤島、火炎放射器、ギブアップ用爆弾） | － |
| 59～66 | 催眠術キット（お前は魚だ、お前はオタマジャクシだ、お前はミジンコ） | － |
| 67～74 | 見世物小屋（ソーニャ型のトンボ、着ぐるみのミックス人魚） | － |
| 77～84 | 段ボールで戦車を作る | － |
| 85～92 | あぎりの植物園（ハンマーの実、巨大ヘビイチゴ、伝説の剣芋） | － |
| 95～102 | 福袋（色鉛筆120本セット、スパイカメラ眼鏡） | － |
| 103～110 | 刺客コブラキング（ラミアソーニャ、石化） | － |
| 111～118 | 刺客ヘヴィーメタルスネーク | － |
| 単行本第11巻（2020年2月11日発行） |
| ページ | エピソード概要 | 備考 |
| 表紙 | 焼けた鉄棒（ダイナマイト）でバトンリレー | － |
| カラー | キルミーサイコロ | － |
| カラー | キョンシーベイベー | － |
| 9～16 | 雨と傘（すでに壊れていた傘、超ロング傘、光る傘） | － |
| 17～24 | あぎりの病院型テーマパーク（レントゲン、巨大注射器、頭部ギプス） | － |
| 25～32 | のど自慢の練習（物理的に最強、段ボール防音室、ボイスパーカッション） | － |
| 33～40 | 野外でイノシシ鍋（ロボイノシシ、イノシシロボ） | － |
| 43～50 | お面いろいろ（目玉が出る、高性能サバイバルマスク、戦いの神のマスク、呪われたマスク） | － |
| 51～58 | 海底の財宝探し（あぎりの潜水服、エアに激辛ソース、大ダコ、電気ショック） | － |
| 59～66 | 体育祭の準備（つきたてのお餅1キロ、○×ボード、寿命や脳を借りてくる競走） | － |
| 67～74 | いろいろな時計（カラクリハト時計、呪いのヒト時計、ドローン目覚まし時計） | － |
| 77～84 | 偽ソーニャ（似ていない、刺客キリングキックパンチャー） | － |
| 85～92 | 花火セット（ロケット型の線香花火、ブラック花火、ネコ花火［殺鼠剤］、ヘビ［毒］花火、スッキリ洗浄花火） | － |
| 93～100 | 飛行機墜落（忍びクモザル、パラシュートが足りない、クモザルたちの島） | － |
| 103～110 | 芸術の秋（暴力の秋、真面目にソーニャを描いたがクリーチャーに、あぎりの判定） | － |
| 111～118 | ペットを飼う（私に飼われてみるんだよ、ヘビのような犬、ゾウのようなネコ） | － |
| 単行本第12巻（2021年4月10日発行） |
| ページ | エピソード概要 | 備考 |
| 表紙 | 大量のやすな＆ソーニャ（一つだけ異なる） | － |
| カラー | キルミーマリオネット | － |
| カラー | 食通（没キャラ）の前で料理対決 | － |
| 9～16 | 変装セット（ソーニャの真似、不思議な黒眼鏡、お題生成、コンブ、怪獣とミサイル） | － |
| 17～24 | 雪山登山（動かないスノーモービル、イエティー、雪崩） | － |
| 25～32 | 頭の良くなるメガネ（2+1=?、鏖、マヨネーズを吊して箒で叩く） | － |
| 33～40 | あぎりの釣り堀（デンキウナギ、テブクロダコ、人面魚、カッパ？） | － |
| 43～50 | 日本刀（血糊が出るベスト、飛び道具） | － |
| 51～58 | コックリさん（対人戦、憑依と除霊、電気十字架） | － |
| 59～66 | ギャグ（刺客デッドマッシュヘッドのワライダケビーム、ショベルカーの物真似、感情を破壊するビーム） | － |
| 67～74 | 筋力増強トレーニング（開かないジャム瓶、エアダンベル、巨大サプリメントで胴が伸びる、超電流腹筋パッド） | － |
| 77～84 | 牢に入れられた（秘密結社銀の夕暮れ団、ノコギリザメ、教祖さま、浄化生贄ファイヤー） | － |
| 85～92 | 分身の術（再合体すると大きくなる、コピーエラー、分身が謀反） | － |
| 95～102 | 刺客ナイトメアテイパー（イメージを出して戦う、フェイタリティコズミックブレード、バナナ食べたい） | － |
| 103～110 | ターゲットの隣の家で（サンタ参上、幽霊の掛け軸、ロシアンルーレットケーキ、ククリナイフ投げ） | － |
| 111～118 | ソーニャロボット（本物選手権、大きな改良型） | － |
| 単行本第13巻（20年月日発行） |
| ページ | エピソード概要 | 備考 |
| 表紙 | 。 | － |
| カラー | 。 | － |
| カラー | x | － |
| x～ | x | － |
| x～ | x | － |
| xｐ～ | x | － |
| x～ | x | － |
| x～ | x | － |
| x～ | x | － |
| x～ | x | － |
| x～ | x | － |
| x～ | x | － |
| x～ | x | － |
| x～ | x | － |
| xせ～ | x | － |
| x～ | x | － |
| 単行本第14巻（2023年7月12日発行） |
| ページ | エピソード概要 | 備考 |
| 表紙 | キルミー知育パズル（9マス並べ） | － |
| カラー | キルミーソー・マトロープ | － |
| カラー | 超ゴーストハンターボツリヌス | － |
| 9～16 | ゴッドブレイカー（スターターボックス、ダークネビュラヒュドラ、シャモシシャモソルジャー） | － |
| 17～24 | 広場の忍プロレス公演（刺客？ブリムストーン、タスマニアマスク vs. ヤスナ・ザ・グレート、本当の毒の毒霧） | － |
| 25～32 | 三角帽子で魔法使いごっこ（使い魔のクモ、魔女暴き棒） | － |
| 33～40 | あぎりのテーマパークWAIWAIHAWAIILAND（惑星ハワイ、ハワイアン星人、古代人再現、未来のハワイを再現） | － |
| 43～50 | 川下り（カヌー、シップトゥルーパー、火を吐くカッパ） | － |
| 51～58 | クイズ（あぎりの特設会場、鳴き声当て、あけび/あぎり/あがり） | － |
| 59～66 | わんこそば屋（ちゃんこ蕎麦、健康食品バソ・ワンコ） | － |
| 67～74 | カブトムシ（養殖、刺客キングムシ、蟷螂は昆虫？） | － |
| 77～84 | バンド結成（ヤスナーズ、新楽器モヅルペッツ、呪いのお告げ人形） | － |
| 85～92 | 冬の水鉄砲バトル（熱湯、怨霊の憑いた雪だるま、お化けが出る銃） | － |
| 93～100 | 節分（世界大会、呪いの鬼役マスク、エホーブレード） | － |
| 101～108 | 世は空前の犬ブーム!!（犬ポリス、クリーチャー犬を飼うソーニャ） | － |
| 109～114 | ソーニャの引っ越し（引っ越し用のロボ） | － |
| 115～118 | 花粉症のやすな（手や髪が伸びる）
| － |
| 単行本第15巻（2024年10月12日発行） |
| ページ | エピソード概要 | 備考 |
| 表紙 | DXメガビッグジャンボソーニャ割ピン人形 | － |
| カラー | キルミーパズル（ピース） | － |
| カラー | みにくいアキルの子 | － |
| 9～16 | カジノ鍛冶野（チップ、ロシアンルーレットタコ焼きなど） | － |
| 17～24 | 文房具（キュウリ型ペン、デュエルペンシルなど） | － |
| 25～32 | 危険なプールバイト（電気プール、鮫の霊など） | － |
| 33～40 | 図書館（呪いの本、暗殺拳のターゲットなど） | － |
| 43～50 | サーカス（虚弱な組体操、やすなの火の輪くぐり、全身拘束してのナイフ投げ） | － |
| 51～58 | 木工DIY（小さな椅子、禁じられた生命、うどん） | － |
| 59～66 | 雪山遭難（ビッグフットと祭壇） | － |
| 69～76 | 忍術を忘れてしまったあぎり（釘バット、分身の術など） | － |
| 77～84 | ダンスコンテスト（バロン・バタフライ、刺客のレヴォリューション・D） | － |
| 85～92 | 学校の七不思議（チミパーケミパー、見ると死ぬ絵、イワシになって消える） | － |
| 95～102 | カレー屋で手術（極み深海丼、医療用ランス、全身もぐさ） | － |
| 103～110 | カニキングバトル（人工ガニ、マルチハンドガニ、SSRヘルポイズンデスキャンサー） | － |
| 111～118 | やすなのバイト（ラーメン出前、新薬の試験、迷い猫探し、邪教の儀式） | － |
（以下続刊中）
